新型冠狀病毒（COVID-19）與癌癥診療之Q&A——新型冠狀病毒（SARS-CoV-2）的變異
Question5.新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)的變異。
SARS-CoV-2的基因大小為29.9 kb，平均每月發(fā)生2處突變。多數(shù)突變不會影響傳染性或致病性，但是持續(xù)傳播會增加免疫逃逸的幾率，或增加傳播的適應(yīng)性機(jī)會。其中，刺突基因內(nèi)的突變會影響感染能力和中和抗體的作用，因此需要關(guān)注。SARS-CoV-2的刺突蛋白由1,273個氨基酸組成，病毒表面富集三聚體。刺突蛋白的受體結(jié)合結(jié)構(gòu)域(RBD)與細(xì)胞表面的ACE2結(jié)合后，弗林蛋白酶將其在R685 / S686之間裂解，形成S1和S2亞基。TMPRSS2在R815 / S816的S2'位點進(jìn)一步切割S2亞基，以促進(jìn)病毒膜融合。
ACE2受體結(jié)合域(RBD)位于S1亞基內(nèi)，許多中和抗體可識別并與RBD結(jié)合。因此，該區(qū)域的氨基酸突變特別令人關(guān)注。刺突蛋白的D614G突變體在日本占主導(dǎo)地位。《細(xì)胞》雜志2020年9月的月刊中報道，比較了約100種刺突區(qū)域突變病毒株的感染性和對中和抗體的反應(yīng)性后，發(fā)現(xiàn)D614G突變比原始菌株更具傳染性。
此外，據(jù)報道，諸如N234Q，L452R，A475V和V483A的突變對某些單克隆中和抗體的反應(yīng)較弱。
文獻(xiàn)：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32730807/
值得注意的變異病毒珠被稱為VOI(感興趣的變種)，其中具有較強(qiáng)傳染性和致病性的被稱為VOC(關(guān)注的變種)。迄今為止被報道VOC出現(xiàn)在英國，巴西和南非。在英格蘭肯特郡大爆發(fā)病毒株B.1.1.7有23個突變，突變數(shù)比其他病毒株更多，在他的刺突基因中發(fā)現(xiàn)了9個突變。這個在英國流行的病毒株的突變，比在日本流行的D614G突變多了一個N501Y突變，該突變可增加人和小鼠的ACE2親和力。
文獻(xiàn)：https://www.cogconsortium.uk/news_item/update-on-new-sars-cov-2-variant-and-how-cog-uk-tracks-emerging-mutations/
刺突基因內(nèi)的E484K突變體在南非和巴西流行，已經(jīng)顯示出他們正在增強(qiáng)人類之間的傳播能力。日本的國立傳染病研究所也對其國內(nèi)的突變進(jìn)行監(jiān)測，并公布了結(jié)果。
公布：https://www.niid.go.jp/niid/ja/diseases/ka/corona-virus/2019-ncov/10084-covid19-28.html
日本慶應(yīng)義塾大學(xué)的一個研究小組采集了2020年8月和12月在日本出現(xiàn)E484K突變病毒株，發(fā)現(xiàn)它們不僅有從國外流入的，也有在日本國內(nèi)發(fā)生突變的。英國的變異病毒株中也發(fā)現(xiàn)了E484K突變。增加了ACE2親和力的病毒不僅會增加人與人之間的傳播，而且還可以在短時間內(nèi)在全身復(fù)制，它可能加重病情。流行病學(xué)研究表明，這些突變病毒株之間在加重疾病或致死率中沒有差異，但隨后研究的深入，有多篇文獻(xiàn)已經(jīng)報道了英國突變病毒株的確增加了感染者的重癥化。據(jù)報道，英國突變病毒株的傳播能力最大可增加到1.7倍，而實際的傳播是按照時效復(fù)制的數(shù)量來測量的，戴口罩之類防護(hù)措施也降低了感染率。
文獻(xiàn)：https://science.sciencemag.org/content/early/2021/03/03/science.abg3055.full
本文共同作者
■WG長
寺嶋 毅(東京歯科大學(xué)市川総合病院 呼吸器內(nèi)科)
■WGメンバー
【日本癌治療學(xué)會】
江藤正俊(九州大學(xué)大學(xué)院醫(yī)學(xué)研究院 泌尿器科學(xué)分野)
掛地吉弘(神戸大學(xué)大學(xué)院醫(yī)學(xué)研究科 食道胃腸外科)
調(diào) 憲(群馬大學(xué)大學(xué)院醫(yī)學(xué)系研究科 総合外科學(xué)講座肝膽膵外科分野)
西村恭昌(近畿大學(xué)醫(yī)學(xué)部 放射線腫瘍學(xué)部門)
藤原俊義(岡山大學(xué)大學(xué)院醫(yī)歯薬學(xué)総合研究科 消化器?腫瘍外科學(xué))
【日本癌學(xué)會】
清野 透(國立がん研究センター 先端醫(yī)療開発センター)
高山智子(國立がんセンターがん対策情報センター がん情報提供部)
松尾恵太郎(愛知県がんセンター研究所 がん予防研究分野)
松岡雅雄(熊本大學(xué)生命科學(xué)研究部 血液內(nèi)科)
三森功士(九州大學(xué)病院別府病院 外科)
【日本臨床腫瘍學(xué)會】
市原英基(岡山大學(xué)病院 呼吸器?アレルギー內(nèi)科)
小林信明(橫浜市立大學(xué)附屬病院 呼吸器內(nèi)科)
小山泰司(神戸大學(xué)醫(yī)學(xué)部付屬病院 腫瘍?血液內(nèi)科)
姫路大輔(県立宮崎病院 內(nèi)科)